Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms