Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP6AP1Q15904 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms