Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNIP1Q15025 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms