Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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