Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms