Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms