Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms