Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP46P62068 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP46P62068 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP46P62068 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP46P62068 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP46P62068 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP46P62068 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP46P62068 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
USP46P62068 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP46P62068 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP46P62068 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP46P62068 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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