Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNPDA1P46926 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNPDA1P46926 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms