Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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