Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms