Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms