Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
OTX2P32243 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
OTX2P32243 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms