Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRHP20396 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRHP20396 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRHP20396 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRHP20396 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms