Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNT1P13805 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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