Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms