Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms