Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms