Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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