Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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