Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms