Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMILIN3Q9NT22 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms