Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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