Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLCO1B3Q9NPD5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms