Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDAC8Q9BY41 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms