Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOL6Q9BWW8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOL6Q9BWW8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOL6Q9BWW8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOL6Q9BWW8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOL6Q9BWW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOL6Q9BWW8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms