Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PI4K2AQ9BTU6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms