Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RTKNQ9BST9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.7 ms