Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM79Q9BSE2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM79Q9BSE2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms