Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms