Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms