Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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