Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP3Q8WYN3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms