Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC82Q8N4S0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms