Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB43Q86YS6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB43Q86YS6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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