Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms