Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2Q1Q7Z7E8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms