Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL2Q6F5E8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms