Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PROX2Q3B8N5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms