Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CDO1Q16878 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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