Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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