Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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