Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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