Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms