Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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