Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms