Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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