Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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