Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX3Q13761 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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