Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms